www.arareko.net

"There is no difference between religion and politics. Both involve lies and fanatical beliefs that generaly defy logic... Just like rock climbing."

- Dave Schuller

Archive for September, 2004

Thursday, September 30th, 2004

No more HMM’s for now…

Today I finished my consultancy work for the Infection and Immunity department at the Infectious Diseases Research Center (CISEI) from the National Public Health Institute of México.

The work consisted on finding all the possible immunoglobulin domains (from the IG and TR groups) in the 12th chromosome of the mouse (Mus musculus) genome using Hidden Markov Model methods.

Unfortunately we didn’t got the expected results, but the methodology was very interesting

Thursday, September 30th, 2004

parse_hmms.pl [--po] [--ps] -m index_file

I’ve just finished a parser for multiple HMMER search results using BioPerl. You just have to give an INDEX file to the program and it will parse as many search files as you want. A sneak of the code here:

while (my $result = $in->next_result()) {
  while (my $hit = $result->next_hit()) {
    while (my $hsp = $hit->next_hsp()) {
      $pos_scores++ if ($hsp->score() >= 0) && $opt_ps;
      my $hmm_string = $hsp->query_string();
      $hmm_string =~ s/<-\*$//;
    }
  }
}

One less thing to worry about

Wednesday, September 29th, 2004

No es un mito… ¡el Amo existe!

Siempre creyó que era un mito. Una manifestación más del ingenio poético-histórico de la humanidad. Un constructo social fruto del imaginario concensuado a través de los siglos como representación axiológica de la maldad. Una historia más que las abuelas suelen contar a los nietos y que las tías suelen creer… pero no es así…

Ayer, créanlo o no… la tía Yola sintió su presencia. Sí, la misma tía que se empeda con anís y prepara tortas de rajas mientras cuenta historias a sus queridos sobrinos… ¡lo sintió!

Satanás, Belcebú, Lucifer, el diablo, el demonio, el Amo del Merol, en cualquiera de sus malignas advocaciones es característicamente representado por dibujos con llamas, cuernos, patas de chivo, trinches, cola; pintado de color rojo, con ojos saltones, como ángel caído… en fin… depende del ícono que elijamos o la corriente artística que se prefiera. Sin embargo hay algo esencial que lo acompaña por doquier, que antecede su presencia, que delata su maligno y perverso “obrar”: El característico olor a azufre. Esa particular mezcla de huevo podrido y decadencias intestinales que narraba Dante en La divina comedia… lo llena todo a su paso, haciendo patente “Su presencia”.

La tía no argumentó nada mientras manejaba el Beto-móvil, simplemente se limitó concentrar su mirada en los carriles del periférico… pero sentía la presencia del Amo cerca… tan cerca que juraría por el fétido aroma de maldad que llenaba el entorno, que traía al puritito demonio en el asiento de atrás…

No la tachen de esotérica o fanática… a lo mejor era verdad…

Monday, September 27th, 2004

Armed to the teeth…

Today Beto and I went to Mercado Hidalgo for buying a Cordless SDS Rotary Hammer Drill for bolting new rock climbing routes. Specifications for our new toy are here (in case you’re interested) and a picture of it here:

Now we’re armed to the teeth

Sunday, September 26th, 2004

Ñadó + Aculco = Excellent workout

Today we went to do some trail-running at Ñadó’s mount and some climbing at Aculco’s canyon.

Armando, Gina, Güero and I drove the highway to Aculco very early in the morning. We arrived at the mount’s base around 11 a.m. We changed clothes and warmed up a little, then we started running all along the trail that goes to the top of the mount. While we men went running on the trail, Gina went for a more relaxed hike up the hill.

There was a point on the trail where I lost visual contact of Armando and Güero and I took the wrong turn on the trail, to the point where I noticed that I was getting into a big gorge, so I decided to make a direct cut into the woods until finding the main trail again. After 20 minutes I was back again on it and nearing the summit of the mount.

When I reached the walls from the mount’s summit I heard that Güero and Armando were already on top of them. I started the climb into a very easy but exposed gully which was soaking wet from all the year’s rain. I reached the summit 1 hour 10 minutes after leaving the car. It was very cold and cloudy so we decided to get down inmediately.

One thing is to climb up, but to climb down an exposed and wet gully like that is a whole different task. We were really frightened of falling on the descent, because it was really slippery and we were on running shoes. After 30 minutes of terror we where down the walls and started the downhill run. We were at the car again 2 hours 12 minutes after leaving it. We did some stretching and headed to Aculco for eating some breakfast.

After breakfast we drove to Aculco’s canyon to do some climbing if the “un-nameable” rain would let us. We climbed a few routes: El Nopal, Psicosis (Armando’s whole life predilect route) and Chompepes (which to me falls into the “5.9 squeeze” type of 5.11 instead of the simple 5.11a at which it’s actually rated). We finished the climb with a big rain storm on our heads and we decided to call it “a day” and ran away from there back to Mexico City.

We arrived at the city and went for a very well deserved salad bar dinner at Ruby Tuesday (big chocolate dessert included!), then we went home. A very fun day to remember!

Saturday, September 25th, 2004

La Cocina de la Tía Yola

Mis sobrinos me han contado muchas historias esta semana y como anciana tía que soy, he decidido invitarlos a mi cocina a que prueben mis exquisitas tortas de rajas mientras les cuento yo también una historia (cof cof cof… tengo hipotermia y un insomnio de terror).

Mis queridos sobrinos… gracias por compartirme cosas tan personales de sus vida, es mi deber como buena tía, contarles también una historia… ¿Acaso no hacen eso las tías mientras le preparan a los sobrinos unas tortas de rajas y alivian sus penas? Pues yo no soy la execpción de la regla, soy la tía Yola Godoy….

Yo creo que todos tenemos momentos que han marcado nuestra vidas de manera negativa, a veces quizá esos son los que más recordamos y los que más impacto tienen en nosotros… los que nos negamos a olvidar, no sé porqué maldita razón… (mientras comienzo a contarte esto, saco mis instrumentos para preparar las tortas de rajas, el cuchillo, las rajas, los bolillos y me pongo mi mandil rosa mexicano que dice con letras negras… “Para esto fuí a la universidad” y neta si tengo uno así jajajaja me lo dio mi hermana)

No queremos olvidar estos sucesos traumáticos como las soledades en el recreo… claro sobrino yo también tuve las mías… a mi me discriminaban por greñuda… porque no me peinaba… y no me peinaba no porque no quisiera, sino porque tuve una educación muy extraña… (en eso tomo los chiles y los aso en el comal… la verdad no tengo “#$%& idea cómo se hacen las rajas… pero se supone soy la tía y tu me esccuchas mientras yo hago rajas y cuento historias…) Cuando yo nací mi mamá tenía 43 años, ya era demasiado grande para tener una hija, y al nacer yo, le dió un infarto…. le dieron 6 meses de vida… y yo tenía media hora de nacida. Entonces decidió que me iba a educar de forma que yo no necesitara de nadie para salir adelante en la vida… es decir, desde chiquita yo tenía que lavar mi ropa, peinarme sola, jamás me ayudó a hacer una sola tarea, y trataba de no estar conmigo… para que yo no la extrañara cuando ella muriera… cuando le pedía que me contara un cuento en las noches, me decía que yo tenía que aprender a leer. Así me enseñó a leer a los cuatro años y cada vez que yo la buscaba me daba un libro… le preguntaba algo y me daba un libro, crecí muy sola…. así pues aprendí que las negaciones de amor se curan con palabras escritas…

Yo crecí como la greñuda descuidada que no se adaptaba entre niñas bonitas, peinadas, limpiecitas… yo era la rara que escribía cuentos en los cuadernos de matemáticas… jajaja… Nunca me adapté con nadie (sigo sin hacerlo) y acabé estudiando literatura jajaja. La irónica vida, ha dejado que viva con mi mamá 28 años… de hecho ella tiene casi 72… y hace mucho mandó a la fregada las predicciones de los doctores. De hecho yo me enteré de esta historia de la presunta amenaza de muerte hace como 3 ó 4 años… (mientras te cuento esto parto los bolillos y los pongo en la mesa para hacer las tortas como buena tía… y preparo… mmm ¡chocolate de molinillo marca La abuelita…!)

No quiero hacerlese el cuento largo sobrinos… pero las experiancias que he vivido, las transformé en algo raro… acepté mis diferencias y dejé de buscar amigos… nunca he estado en un grupo social, nunca frecuento a mis amigos, jamás les hablo, jamás voy a sus fiestas, los evito de hecho… en secundaria mi mejor amiga me bajó al primer chavo que me gustó en mi vida… jajaja…. estaba bien guapo y cuando le dije que me gustaba… me dijo, “yo te lo presento” y a las dos semanas los vi besándose en el pasillo jajajaja… che vieja. Me vale madres la aceptación social, porque jamás la voy a tener. Me vale madres la gente que me rodea (salvo mi familia) porque jamás voy a cumplir sus expectativas…

Hoy que me preguntó mi sobrino Mauricio sobre ¿qué piensan mis amigas? es muy chistoso… conocen muy pero muy poco de mi… decidí no platicarles nada de mi vida… precisamente así evito los juicios y las molestas intromisiones… Hago lo que ellas no pueden hacer y eso a veces les gusta y a veces les molesta tremendamente… a veces envidio sus vidas tranquilas y sin conflictos… pero ni por error cambiaría a Lázaro por sus Windstar, mis manos de momia llenas de cayos por un anillo de matrimonio, ni mis deudas por una cuenta de banco… y aunque me cueste un chingo decirlo… mi libertad por un guey que no entienda quien soy…. (ahí la tía se emociona y saca su botella de anis y prepara dos vasitos, uno para el sobrinito Beto y otro para el sobrinito Mauricio… ella… che tía le gusta el chupe mientras cocina sus tortas de rajas… y toma directo de la botella mientras le tiembla la lágrima y saca su cassette viejo y aguado de Lupita D’alessio)

Con el tiempo he aprendido que el desamor se cura con libros, la frustración con rocas y las dudas se resuelven en las montañas… Que Dios es al único al que le importo (soy creyente aunque nadie me crea jajaja) y que el día que muera mi madre… realmente me costará trabajo encontrar razones para despertar.

No es que no necesite a los amigos… es que nunca los he tenido y me he topado con gente maravillosa, pero eso de los apegos en mi… son momentáneos y circunstanciales. Hay gente que quiero muchísimo, pero jamás la frecuento. Si alguien me necesita trato de estar, pero yo rarísima vez busco a alguien… de cualquier modo jajaja … sé que no hay nadie jajajaja

Así pues, sobrino Beto… no intentes buscar a nadie o buscar la aceptación…. no sirve de un carajo! (ya la tía se chupó la botella de anís, se le quemaron las rajas, se oreo el pan de las tortas y se tiró el chocolate Abuelita que estaba en la estufa) Y si nadie te quiere, como a veces nos sucede a todos aunque lo ocultemos, ¿qué? Mi solución es simple… Dios me ama, mi jefa está viva, tengo libros por leer, rocas por subir… ¡qué chingados me importa la gente! ¿Que no encajo en ningún lado?… jajaja… !!ellos no encajan conmigo!! (ya la tía está peda con el anís y comienza a sacar las fotos del recuerdo…)

Así pues sobrino Mauricio… ¿eh? (che alzhaimmer hizo presa de nuevo de la tía) Ah tu no me pediste consejo alguno jajaja…. bueno sobrino deja ya las viejas por internet un día te vas a topar un ¡trasvesti!…

En fin sobrinos… sus historia son únicas, como la mía, como la de todos… y poco podemos elegir pues no escogimos donde nacer, cómo ser, quién nos educa o cómo lo hacen… quien nos rodea… de hecho podemos elegir tan poco… Pero creo que la libertad es lo que realmente nos hace humanos, el libre albedrío es la mayor bendición y a la vez la mayor maldición… en lo poco que pude elegir… elegí mandar al carajo a todos. No sé si soy más o menos feliz… simplemente soy yo (ya en esta parte la anciana tía se quedó jetona en la mesa de la cocina con la tella del anís en la mano y todo hecho un desmadre… y los sobrinos se preguntan qué chingados quiso decir y qué viene todo este desmadre de la historia de su vida que nadie le preguntó… chale pobre tía hipotérmica jajaja).

No hubo consejo, no hubo comprensión, ni hubo tortas de rajas, hay como siempre lo he creido, breves momentos en los que se comparten soledades… y qué hermoso es coincidir, aunque sea por un instante.

P.D. BORREN ESTA MADRE DESPUÉS DE QUE LA LEAN PORQUE NOMÁS FUE EL MOMENTO “MEROL” DE LA SENSIBILIDAD YOLEZCA… jajaja

Friday, September 24th, 2004

Here we go again…

Today we were at the university campus as usually… hard training (Judith, Beto and I).

This time we arrived there very late. It was about 8 p.m., totally dark and raining like if this hurricanes will never stop. But this time we were prepared, we brought our headlamps, so nothing would stop us from training. As I have said in a previous post, Judith (a.k.a. “aunt Yola”) is a “never learn” girl, this time she came dressed in her jeans, a clothing not so comfortable for climbing, even on a sunny day! But there she was…

The chronometer started and the MP3 player was screaming out heavy metal music (a.k.a. “Merol” in this part of the earth). About 1 hour after traversing all along this big muddy wall we were out of the problem and heading to Coyoacán. We drank some very well deserved double mocha coffees and smoked a pair of cigarettes. It’s worth to mention that while Beto and I were drying out our clothes very efficiently, Judith was nearing hypothermia because of her soaking wet jeans. We hope this time the “never learn” girl learns something…

This was the best song for the climax on the wall:

slayer – scarstruck

come step inside my hate you know there’s nothing to it
step inside my pain you’ll never make it through it
once you’re sucked into my sado-paradise
lose your mind inside the pleasure lies within your pain

drown in my hate you know, you know
brutality’s the way of this world
branded and scarred defy, defy
a comatose and blind existence
hatred holocaust you see in me
it’s more than just a way of life
i’ve re-invented the way
i relate to this complacent world

all of life decays
rapes my eyes
screams never silence the pain
death is like an old friend
i can’t wait to watch you die

i am you vice so real, so real
desires of the scars of new flesh
bathe in you blood excites/incites
the ritualistic lacerations
inhumanities profane, insane
inflicted since the dawn of time
make your peace with god – goodbye
and embrace the pain that burns inside you

all of life decays
rapes my eyes
screams never silence the pain
death is like an old friend
i can’t wait to watch you die
i can’t wait

come step inside my hate you know there’s nothing to it
step inside my pain you’ll never make it through it
redefine your life in sado-paradise
necessary cleansing of the mind’s eye
love and agony electric ecstasy
can’t get enough euphoric serenity
stains won’t fade away forever scarstruck
they never fade away forever scarstruck

drown in my hate you know, you know
brutality’s the way of my world
branded and scarred defy, defy
a comatose and blind existence
your like the walking dead so blind inside
oblivious to psycho pleasure
i am your new god – ungod
so if you want hell here i am
everything around me decays
rapes my eyes
screams never silence the pain
make you my canvas of pure, fresh, flesh
scarstruck…

Thursday, September 23rd, 2004

Amo + Dean Potter

¿Qué más se puede pedir en la vida?

Por lo pronto a mí no se me ocurre algo más perfecto… sublime y perverso jajajaja Merol!

Wednesday, September 22nd, 2004

No… I am your father

For me, this is the climax of the whole Star Wars saga:

Vader: There is no escape. Don’t make me destroy you… Luke, you do not yet realize your importance. You have only begun to discover your power. Join me and I will complete your training. With our combined strength we can end this destructive conflict and bring order to the galaxy.
Luke: I’ll never join you!
Vader: If you only knew the power of the dark side. Obi-Wan never told you what happened to your father.
Luke: He told me enough. He told me you killed him.

Vader: No… I am your father.
Luke: No… No… That’s not true… That’s impossible!
Vader: Search your feelings. You know it to be true.
Luke: Nooo! Nooo!
Vader: Luke, you can destroy the emperor. He has foreseen this. It is your destiny. Join me and together we can rule the galaxy as father and son… Come with me… It is the only way.

What do you think?

Wednesday, September 22nd, 2004

No rest for the wicked…

And then I was there again today… hard training. This time I went to the university campus with Judith (a.k.a. “aunt Yola”) and Beto (my climbing partner).

Judith is a “never learn” girl, she’s always invoking rain with her spells… We trained hard until the rain got really uncomfortable.

I’ve got again this terrible pain on my arms… I’m a “never learn” boy also…